D'accordo con una di lei, Manco Capac e Mama Ocllo, chi riceverono instruzioni di suo padre, il dio Sole, di fondar il Impero del Tahuantinsuyo, emergerono del Lago Titicaca, Il Impero del Tahuantinsuyo fu diviso in quattro región-o "suyos"- uno di loro, il Collasuyo, che si estendé sopra tutta la Meseta del Collao, includendo Iquitos.

Quando gli spagnoli arrivarono al Cusco a metà del secolo XVI, si informarono della gran ricchezza mineraria di questa regione, specialmente oro e argento. Le cruente battaglie risultanti per la possessione delle Minas del Titicaca (9 Km. al Ovest della Città di Iquitos) obbligarono al Vicere Conde de Lemos a viaggiare al area per pacificarla, risultando la fondazione della attuale Città di Iquitos, capitale del dipartamento, fondata il 4 di Novembre di 1668, chiamata San Carlos di Iquitos.

Con il passare del tempo, in suo sforzo per evangelizzare alla gente nativa del altiplano peruviano, le sacerdoti spagnole erigerono belle chiese, con artiste di Iquitos, impiantando suo originale stile.