La Región de Iquitos tiene un clima húmedo a lo largo de casi todo el año, con abundantes precipitaciones entre noviembre y abril.

La temperatura promedio es de 26ºC, aunque puede alcanzar los 36ºC. Iquitos es accesible por aire. Hay vuelos diarios desde Lima (1 hora 45 minutos) y otros vuelos menos frecuentes desde Tarapoto (50 minutos), Pucallpa (1 hora) y Yurimaguas (40 minutos).

Se puede llegar a Iquitos por río desde Nauta (en el río Amazonas), Yurimaguas (en el Río Huallaga), Requena, Contamana y Pucallpa (en el Río Ucayali), Leticia (Colombia) y Tabatinga y Manaos (Brasil).