Uno de los mitos más populares, de las crónicas guardadas por el Inca Gracilazo de la Vega, es el de una pareja mítica, Manco Cápac y Mama Ocllo, quienes emergieron de las aguas del Lago Titicaca para fundar la ciudad del Cusco y enseñar a su gente a cultivar la tierra.

La ciudad fue dividida en dos sectores; un área alta, o Hanan, y una baja , o o Hurin, haciendo referencia a ambos a la posición geográfica de cada zona y la posición jerárquica de sus habitantes. Más aún, Se dice también que el perfil de la primera ciudad tenía la forma de un puma con la cabeza de un halcón.

Cuando lo españoles llegaron en 1533, muchas estructuras prehispánicas fueron destruidas o usadas como base para unas nuevas, lo cual incluía iglesias, conventos y mansiones construidas en estilos barroco o renacentista. Desde aquella época, el Cusco se ha convertido en una de las expresiones más representativas de la cultura mestiza de América.